JOI 2009-2010 の本選は、２０１０年２月１３日（土）〜２月１４日（日） に東京会場（国立オリンピック記念青少年総合センター）で実施します。詳細は追って発表します。

　予選の結果で本選参加資格を得た者と提携プログラミングコンテストの成績優秀者だけが参加できます。 遠方の参加者には規定に従って交通費を支給します。
　本選の競技内容や実施方法については 競技内容 の項をご覧ください。

　参加者に成績順に A, B, C のランクを付け、成績上位者（Aランク者）約15名が第22回国際情報オリンピック・カナダ大会日本代表選手候補者として、春のトレーニング合宿に招待されます。
　本選の成績上位者（原則として、金賞、銀賞、銅賞各１名）には、メダルと副賞が授与されます。また、ブロックごとの成績上位者も表彰します。

参加者交流 ＆ 問題解説

　2月13日（土）の夜、講師を招いて講演会を行うとともに、懇親会を行います。また、2月14日の本選競技の実施後に、本選で出題した問題の解説を行います。